Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF25Q9BQ70 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TCF25Q9BQ70 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TCF25Q9BQ70 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TCF25Q9BQ70 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TCF25Q9BQ70 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF25Q9BQ70 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF25Q9BQ70 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF25Q9BQ70 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms