Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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