Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN18Q99952 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN18Q99952 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms