Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMD1Q99460 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms