Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KC1Q96S38 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms