Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SAMD11Q96NU1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms