Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TSNARE1Q96NA8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms