Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGD4Q96M96 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms