Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DCHS1Q96JQ0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCHS1Q96JQ0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms