Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED3Q96IU2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED3Q96IU2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED3Q96IU2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED3Q96IU2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED3Q96IU2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED3Q96IU2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED3Q96IU2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED3Q96IU2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED3Q96IU2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED3Q96IU2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED3Q96IU2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED3Q96IU2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED3Q96IU2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBED3Q96IU2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED3Q96IU2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED3Q96IU2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED3Q96IU2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED3Q96IU2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED3Q96IU2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED3Q96IU2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED3Q96IU2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED3Q96IU2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED3Q96IU2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED3Q96IU2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED3Q96IU2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED3Q96IU2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED3Q96IU2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED3Q96IU2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBED3Q96IU2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
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