Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALML4Q96GE6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALML4Q96GE6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms