Protein–RNA interactions for Protein: Q96C10

DHX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX58, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX58Q96C10 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DHX58Q96C10 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DHX58Q96C10 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms