Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MKL1Q969V6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MKL1Q969V6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms