Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TSR2Q969E8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms