Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNPO1Q92973 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNPO1Q92973 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms