Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTT0

CLEC4C, C-type lectin domain family 4 member C, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4CQ8WTT0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLEC4CQ8WTT0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CLEC4CQ8WTT0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLEC4CQ8WTT0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLEC4CQ8WTT0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
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