Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF30

WHAMM, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMQ8TF30 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms