Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PNLDC1Q8NA58 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms