Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms