Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NME8Q8N427 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME8Q8N427 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
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