Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NPM2Q86SE8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NPM2Q86SE8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms