Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC11Q7Z392 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRAPPC11Q7Z392 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms