Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
STRCQ7RTU9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms