Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTOP1Q7RTM1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms