Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZD4Q76G19 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms