Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SMIM5Q71RC9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMIM5Q71RC9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms