Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC129Q6ZRS4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC129Q6ZRS4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms