Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NSMFQ6X4W1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms