Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNT2Q6UVM3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNT2Q6UVM3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNT2Q6UVM3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNT2Q6UVM3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNT2Q6UVM3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNT2Q6UVM3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNT2Q6UVM3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNT2Q6UVM3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNT2Q6UVM3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNT2Q6UVM3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNT2Q6UVM3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNT2Q6UVM3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNT2Q6UVM3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNT2Q6UVM3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNT2Q6UVM3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNT2Q6UVM3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNT2Q6UVM3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNT2Q6UVM3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNT2Q6UVM3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNT2Q6UVM3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNT2Q6UVM3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNT2Q6UVM3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNT2Q6UVM3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNT2Q6UVM3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNT2Q6UVM3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNT2Q6UVM3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNT2Q6UVM3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNT2Q6UVM3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNT2Q6UVM3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNT2Q6UVM3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNT2Q6UVM3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KCNT2Q6UVM3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KCNT2Q6UVM3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KCNT2Q6UVM3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNT2Q6UVM3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms