Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUX4L9Q6RFH8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms