Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY1

BLOC1S2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S2Q6QNY1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BLOC1S2Q6QNY1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms