Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BROXQ5VW32 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
BROXQ5VW32 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BROXQ5VW32 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BROXQ5VW32 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms