Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf135Q5VTT2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms