Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
L1TD1Q5T7N2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms