Protein–RNA interactions for Protein: Q5ST30

VARS2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS2Q5ST30 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VARS2Q5ST30 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VARS2Q5ST30 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VARS2Q5ST30 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VARS2Q5ST30 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VARS2Q5ST30 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VARS2Q5ST30 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VARS2Q5ST30 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VARS2Q5ST30 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VARS2Q5ST30 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VARS2Q5ST30 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VARS2Q5ST30 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VARS2Q5ST30 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VARS2Q5ST30 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VARS2Q5ST30 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VARS2Q5ST30 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VARS2Q5ST30 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VARS2Q5ST30 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VARS2Q5ST30 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VARS2Q5ST30 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VARS2Q5ST30 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VARS2Q5ST30 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VARS2Q5ST30 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VARS2Q5ST30 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VARS2Q5ST30 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms