Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM47AQ5JRC9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM47AQ5JRC9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM47AQ5JRC9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM47AQ5JRC9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM47AQ5JRC9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM47AQ5JRC9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM47AQ5JRC9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM47AQ5JRC9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FAM47AQ5JRC9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM47AQ5JRC9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM47AQ5JRC9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM47AQ5JRC9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM47AQ5JRC9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM47AQ5JRC9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM47AQ5JRC9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM47AQ5JRC9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms