Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms