Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

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Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP100Q494V2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP100Q494V2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
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