Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTF1Q16619 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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