Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCAQ16586 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms