Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDB1Q16531 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
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