Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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ZFHX3Q15911 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZFHX3Q15911 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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