Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA6Q15825 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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