Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR6A1Q15406 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms