Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKD1Q15139 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKD1Q15139 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKD1Q15139 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKD1Q15139 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKD1Q15139 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKD1Q15139 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKD1Q15139 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKD1Q15139 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRKD1Q15139 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRKD1Q15139 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKD1Q15139 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKD1Q15139 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKD1Q15139 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKD1Q15139 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKD1Q15139 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKD1Q15139 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKD1Q15139 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRKD1Q15139 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKD1Q15139 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKD1Q15139 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKD1Q15139 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKD1Q15139 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKD1Q15139 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKD1Q15139 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKD1Q15139 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKD1Q15139 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKD1Q15139 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKD1Q15139 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKD1Q15139 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKD1Q15139 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKD1Q15139 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKD1Q15139 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKD1Q15139 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKD1Q15139 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKD1Q15139 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKD1Q15139 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKD1Q15139 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRKD1Q15139 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKD1Q15139 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKD1Q15139 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKD1Q15139 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKD1Q15139 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRKD1Q15139 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKD1Q15139 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKD1Q15139 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKD1Q15139 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKD1Q15139 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKD1Q15139 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKD1Q15139 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKD1Q15139 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKD1Q15139 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKD1Q15139 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKD1Q15139 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKD1Q15139 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKD1Q15139 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKD1Q15139 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRKD1Q15139 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKD1Q15139 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKD1Q15139 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKD1Q15139 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKD1Q15139 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKD1Q15139 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKD1Q15139 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKD1Q15139 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKD1Q15139 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKD1Q15139 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKD1Q15139 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKD1Q15139 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRKD1Q15139 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKD1Q15139 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKD1Q15139 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKD1Q15139 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKD1Q15139 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKD1Q15139 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRKD1Q15139 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKD1Q15139 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRKD1Q15139 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKD1Q15139 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRKD1Q15139 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKD1Q15139 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKD1Q15139 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKD1Q15139 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PRKD1Q15139 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKD1Q15139 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRKD1Q15139 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRKD1Q15139 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRKD1Q15139 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKD1Q15139 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRKD1Q15139 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKD1Q15139 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRKD1Q15139 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRKD1Q15139 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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