Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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