Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNIP1Q15025 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNIP1Q15025 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms