Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALCAMQ13740 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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