Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
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