Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRQ13535 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRQ13535 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRQ13535 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRQ13535 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRQ13535 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRQ13535 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRQ13535 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRQ13535 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRQ13535 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRQ13535 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRQ13535 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRQ13535 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRQ13535 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRQ13535 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRQ13535 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRQ13535 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRQ13535 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRQ13535 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRQ13535 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRQ13535 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRQ13535 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRQ13535 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRQ13535 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRQ13535 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRQ13535 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRQ13535 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRQ13535 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRQ13535 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRQ13535 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRQ13535 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRQ13535 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRQ13535 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRQ13535 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRQ13535 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRQ13535 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRQ13535 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRQ13535 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRQ13535 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRQ13535 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRQ13535 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRQ13535 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRQ13535 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRQ13535 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRQ13535 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRQ13535 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRQ13535 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRQ13535 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRQ13535 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRQ13535 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRQ13535 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRQ13535 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRQ13535 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRQ13535 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRQ13535 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRQ13535 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRQ13535 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRQ13535 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRQ13535 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRQ13535 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRQ13535 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRQ13535 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRQ13535 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRQ13535 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRQ13535 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRQ13535 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRQ13535 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRQ13535 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRQ13535 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRQ13535 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRQ13535 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRQ13535 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRQ13535 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRQ13535 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRQ13535 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRQ13535 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATRQ13535 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATRQ13535 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATRQ13535 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATRQ13535 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATRQ13535 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATRQ13535 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATRQ13535 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATRQ13535 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATRQ13535 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATRQ13535 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATRQ13535 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATRQ13535 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATRQ13535 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATRQ13535 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRQ13535 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRQ13535 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRQ13535 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRQ13535 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRQ13535 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRQ13535 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRQ13535 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRQ13535 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRQ13535 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRQ13535 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
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